В статье исследуются особенности межгрупповых конфликтов в  органах  государственной  власти  Российской  Федерации  на примере  Федерального  агентства  водных  ресурсов.  Анализируется широкий круг факторов, приводящих к возникновению конфликтов, показывается влияние социально-экономических, политических  и  правовых  условий  на  зарождение  и  развитие конфликтов. В анализе используются авторская типология конфликтов  и  авторская  модель  исследования  их  динамики.  Дается прогноз развития конфликтов в современных российских условиях.